I registri del protocollo della Direzione si sono conservati sostanzialmente per intero. Per i primi anni di funzionamento del Manicomio sono compilati con grande accuratezza: contengono tutti i dati indicati nelle fincature. Ciò è importante se si tiene conto della totale lacuna del carteggio prodotto dalla Direzione durante gli anni di Augusto Giannelli.
Dalla fine degli anni '20, poco dopo la chiusura della sede di via della Lungara, è visibile un cambiamento, non in meglio, nella compilazione dei registri; l'aumento progressivo del volume di corrispondenza ricevuta e inviata fa sì che per ogni documento vengano riportati i dati con maggiore approssimazione. Ma il processo di deterioramento delle registrazioni di protocollo conosce un ulteriore passo nel secondo Dopoguerra, per raggiungere il culmine alla fine degli anni '50. Da questo momento, infatti, con grafie sempre meno comprensibili, sono riportati pochi estremi essenziali dei documenti in partenza e in arrivo.
Lacuna per agosto - dicembre 1966.
In fondo alla serie è stato collocato un registro dei vaglia e delle raccomandate.