La corrispondenza del fondo Fortunato posseduto dall'ANIMI, in origine sembra fosse raccolta in fascicoli per argomento e fascicoli per corrispondente, i quali però sono stati successivamente in gran parte smembrati e ricondizionati al fine della utilizzazione nella pubblicazione di carteggi.
Al materiale che faceva originariamente parte dell'archivio Fortunato è stato aggiunto inoltre quello raccolto sempre in occasione della pubblicazione del carteggi, si tratta infatti di lettere spedite dal Fortunato e messe a disposizione dai destinatari in originale.

Corrispondenza costituita soprattutto da lettere, minute di lettere e cartoline, a cui, a volte, sono allegati o aggiunti appunti, note, ritagli di stampa e piccole pubblicazioni. Sono presenti, oltre alla corrispondenza diretta a Giustino Fortunato, le sue minute o le copie di lettere inviate ai suoi corrispondenti, anche gli originali di Giustino Fortunato messi a disposizione dai destinatari. Tra i principali corrispondenti Eugenio Azimonti, Luigi Bodio, Benedetto Croce, Ettore Ciccotti, Ernesto Cali, Raffaele Ciasca, Sergio De Pilato, Francesco Torraca, Umberto Ricci, Arrigo Serpieri, Edoardo Giretti, Gaetano Salvemini, Umberto Zanotti Bianco.